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illumina Nextera DNA文庫制備試劑盒
illumina Nextera DNA文庫制備試劑盒 (24 samples) 貨號:FC-121-1030較快較簡單的文庫制備流程。制備全基因組測序文庫不到90分鐘,而手工操作不到15分鐘。借助Nextera技術(shù),在一個(gè)步驟中利用轉(zhuǎn)座酶將DNA同時(shí)片段化并加上測序接頭進(jìn)行標(biāo)記。此操作流程適用于數(shù)量有限的珍貴樣本,只需要50 ng的起始DNA。
產(chǎn)品名稱:Nextera DNA Library Prep Kit (24 samples)
(附推廣:Service(服務(wù)類)相關(guān)產(chǎn)品,如有需求,請?jiān)谕莆闹胁樵?;更多產(chǎn)品,歡迎咨詢)
產(chǎn)品貨號:FC-121-1030
(對于全基因組測序,Nextera DNA Flex文庫制備試劑盒是Nextera DNA文庫制備試劑盒的推薦替代品,該試劑盒已停產(chǎn)。如果您使用的是用于ATAC-Seq或其他定制應(yīng)用的Nextera DNA文庫制備試劑盒,歡迎你的咨詢)
產(chǎn)品賣點(diǎn):
較快較簡單的文庫制備流程。制備全基因組測序文庫不到90分鐘,而手工操作不到15分鐘。
借助Nextera技術(shù),在一個(gè)步驟中利用轉(zhuǎn)座酶將DNA同時(shí)片段化并加上測序接頭進(jìn)行標(biāo)記。此操作流程適用于數(shù)量有限的珍貴樣本,只需要50 ng的起始DNA。
這款試劑盒提供較快較簡單的操作流程,90分鐘就可以構(gòu)建好上及測序的文庫,手動操作的時(shí)間少于15分鐘。一步即可完成片段打碎和連接接頭的步驟,不需要特殊設(shè)備,實(shí)驗(yàn)室的常規(guī)設(shè)備即可完成整個(gè)文庫構(gòu)建。并且建好的文庫可以適用于illumina的任何測序平臺。
采用Nextera技術(shù),一步即可完成片段打碎和連接接頭的步驟,不需要特殊設(shè)備,實(shí)驗(yàn)室的常規(guī)設(shè)備即可完成整個(gè)文庫構(gòu)建。較適合樣本量極其稀少的珍貴樣本進(jìn)行建庫,這種建庫方法只需要50ng的建庫起始量。并且可以在任何illumina測序設(shè)備上進(jìn)行測序。
Nextera建庫試劑盒還需要配合使用TruSeq Dual Index Sequencing Primer Box(FC-121-1003單端/PE-121-1003雙端),不論是單端測序還是雙端測序,不論是否有index,還是單端或雙端index,這個(gè)試劑盒都是必須的。
另外 Nextera Index kit (FC-121-1011 or FC-121-1012)對于Nextera文庫構(gòu)建也是必需的。不論是混合多少樣本在一個(gè)pooling中。
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紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司
產(chǎn)品名稱:illumina Nextera DNA文庫制備試劑盒 (24 samples) 產(chǎn)品貨號:FC-121-1030
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DNA文庫制備試劑盒類:
品牌 產(chǎn)品貨號 產(chǎn)品名稱
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Illumina二代測序技術(shù),邊合成邊測序(SBS),是廣泛采用的新一代測序(NGS)技術(shù),負(fù)責(zé)產(chǎn)生世界上90%以上的測序數(shù)據(jù)。
Illumina的二代測序技術(shù)稱為邊合成邊測序(Sequencing-by-Synthesis,簡稱SBS)。SBS主要包括堿基延伸、熒光激發(fā)及信號收集、剪切等3個(gè)步驟。這3個(gè)步驟可以重復(fù),循環(huán)進(jìn)行。每循環(huán)一次測定一個(gè)堿基。想測定多少個(gè)堿基(即讀長),就循環(huán)多少次。測序循環(huán)次數(shù)可以在軟件里設(shè)定。到底測序多長合適,要根據(jù)項(xiàng)目性質(zhì)和需求來決定。大多數(shù)情況下,SR實(shí)驗(yàn)(單端測序)測定1x50個(gè)堿基,PE實(shí)驗(yàn)(雙端測序)測定2x150個(gè)堿基。
1 堿基延伸
Illumina測序試劑里所使用的dNTP特色,它們同時(shí)具有兩個(gè)修飾基團(tuán):一個(gè)熒光基團(tuán),一個(gè)可逆終止基團(tuán)。A、G、C、T 4種堿基分別標(biāo)記4種不同的熒光基團(tuán),它們在不同波長的激光激發(fā)下,能夠發(fā)射不同波長(即顏色)的熒光。熒光顏色與堿基種類一一對應(yīng),因此根據(jù)激發(fā)光的波長可以識別堿基。4種堿基的終止基團(tuán)是一樣的。由于終止基團(tuán)的存在,所有dNTP每次都只能延伸1個(gè)堿基,無論給予多長的反應(yīng)時(shí)間。又由于該終止基團(tuán)是可逆的,在熒光信號收集完畢之后,可以用剪切劑切除該終止基團(tuán),使堿基恢復(fù)自然的可延伸狀態(tài),這時(shí)即可繼續(xù)進(jìn)行下一輪循環(huán),再測定一個(gè)堿基。
可逆終止基團(tuán)技術(shù)是Illumina二代測序的一大特色。它與橋式PCR技術(shù)一起,構(gòu)成了Illumina二代測序的兩大支柱,為穩(wěn)定獲得高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)打下了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
2 信號采集
HiSeq系列測序儀具有紅綠兩根激光管,兩個(gè)濾色片。它們兩兩組合,可以形成4種不同的激發(fā)波長,正好分別用于激發(fā)A、G、C、T 4種堿基。
Cluster上所標(biāo)記的熒光基團(tuán)在激光激發(fā)下產(chǎn)生的信號,可以用相機(jī)拍攝或者掃描的方式收集信號。掃描技術(shù)速度比較快,被X10系列采用。由于FC面積比較大,而且上表面和下表面要分別拍照,所以拍照過程相當(dāng)耗時(shí)。對于經(jīng)典的HiSeq 2000來說,一次測序循環(huán)所產(chǎn)生的熒光信號,需要大約40分鐘的時(shí)間才能拍照收集完畢,時(shí)間比測序反應(yīng)本身還要長。
3 剪切
熒光信號收集完畢后,關(guān)閉激光,用剪切劑去除測序引物的延伸產(chǎn)物上的堿基所標(biāo)記的熒光基團(tuán)和終止基團(tuán)。兩個(gè)修飾基團(tuán)均被切除,一方面消去干擾熒光,一方面使鏈末端的堿基回復(fù)到自然的可延伸狀態(tài),為下一輪測序做好準(zhǔn)備。
再重復(fù)合成、激發(fā)、收集等步驟,即可進(jìn)行第二個(gè)堿基的測序。
測序循環(huán)可以重復(fù)多次。理論上可以一直重復(fù),直到信噪比降低得無法有效識別堿基信號為止。由于熒光基團(tuán)的發(fā)光效率持續(xù)不斷在衰減,Taq酶的活性也在持續(xù)不斷地衰減,所以實(shí)際上測序循環(huán)次數(shù)是有限的,大重復(fù)次數(shù)與sbs試劑的配方有關(guān)。測序的循環(huán)次數(shù)可以在軟件設(shè)置過程中人為,這個(gè)重復(fù)次數(shù)就是每個(gè)測序片段的讀長。目前,Illumina平臺的讀長有2x100 bp,2x125 bp,2x150 bp,2x300 bp等多種,其中2x150 bp用得較廣泛。
附推廣:illumina品牌—Service(服務(wù)類)相關(guān)產(chǎn)品:
品牌 產(chǎn)品貨號 產(chǎn)品名稱
illumina品牌 15071960 Harness, Rear Service Door Sensor
illumina品牌 20001098 Infinium® Multi-Ethnic AMR/AFR-8 v1.0 FastTrack Service
illumina品牌 20001108 Infinium® Multi-Ethnic EUR/EAS/SAS-8 v1.0 FastTrack Service
illumina品牌 20001110 Infinium Multi-Ethnic Global-8 v1.0 FastTrack Service
illumina品牌 20001111 Infinium Multi-Ethnic Global-8+ v1.0 FastTrack Service
illumina品牌 20001120 Infinium Omni2.5-8 v1.3 FastTrack Service
illumina品牌 20001128 Infinium® OmniExpress-24 v1.2 FastTrack Service
illumina品牌 20004345 Infinium OmniZhongHua-8 v1.3 FastTrack Service
illumina品牌 20004426 ILMN-Assisted FGx Validation Service
illumina品牌 20004427 ILMN Full Standard FGx Validation Service
illumina品牌 20004428 ILMN Custom FGx Validation Service-Add'l 32 Smp
illumina品牌 20004429 ILMN Custom FGx Validation Service-Add'l 64 Smp
illumina品牌 20004482 Infinium Omni5-4 v1.2 FastTrack Service
illumina品牌 SP-201-1007 NeoPrep? Calibration Service
illumina品牌 SR-50-705001-00 BlueGnome professional service (Local)
illumina品牌 SR-50-705002-00 BlueGnome professional services (Regional)
illumina品牌 SR-50-705003-00 BlueGnome professional services (ROW)
illumina品牌 SV-475-1001 Illumina High-Throughput Sequencing Consulting Service
illumina品牌 SV-500-1001 Service Parts and Labor Estimate
illumina品牌 SV-800-1000 Service Contract Upgrade
illumina品牌 TR-203-0021 Instrument Field Service Training
illumina品牌 TR-203-0022 Instrument Field Service Training Recertification
單端測序:單端測序(Single-read)首先將DNA樣本進(jìn)行片段化處理形成200-500bp的片段,引物序列連接到DNA片段的一端,然后末端加上接頭,將片段固定在flow cell上生成DNA簇,上機(jī)測序單端讀取序列。
雙端測序:雙端測序(Paired-end)方法是指在構(gòu)建待測DNA文庫時(shí)在兩端的接頭上都加上測序引物結(jié)合位點(diǎn),在*輪測序完成后,去除*輪測序的模板鏈,用對讀測序模塊(Paired-End Module)引導(dǎo)互補(bǔ)鏈在原位置再生和擴(kuò)增,以達(dá)到第二輪測序所用的模板量,進(jìn)行第二輪互補(bǔ)鏈的合成測序。
基因測序是一種新型基因檢測技術(shù),能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預(yù)測罹患多種疾病的可能性,個(gè)體的行為特征及行為合理?;驕y序技術(shù)能鎖定個(gè)人病變基因,提前預(yù)防和治療。
基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術(shù),是下一個(gè)改變世界的技術(shù) 。
基因測序只是基因檢測的方法之一,其又叫基因譜測序,是上*的一種基因檢測標(biāo)準(zhǔn)。
基因測序廣為人知的還有針對唐氏綜合征篩查的無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測。只需要采集孕婦的外周血,通過對血液中游離DNA(包括胎兒游離DNA)進(jìn)行測序,并將測序結(jié)果進(jìn)行生物學(xué)分析,從而得出胎兒是否患有染色體數(shù)目異常的疾病,包括常見的21-三體綜合征(唐氏綜合征)、18-三體綜合征(愛德華氏綜合征)和13-三體綜合征(Patau綜合征)。
基因組文庫是指將某生物的全部基因組DNA切割成一定長度的DNA 片段克隆到某種載體上而形成的集合。基因組文庫根據(jù)DNA 來源又分為核基因組文庫、葉綠體基因組文庫及線粒體基因組文庫?;蚪M文庫構(gòu)建時(shí)遺傳信息供體是基因組DNA,因而無發(fā)育時(shí)期及組織器官特異性,在一個(gè)*的基因組文庫中包含著基因組DNA 上的所有編碼區(qū)及非編碼區(qū)序列的克隆; 生物有機(jī)體的每一個(gè)基因在文庫中都有其克隆,該克隆的基因片段里包括著間隔序列,所以基因組文庫可真實(shí)地顯示基因組的全部結(jié)構(gòu)信息。
基因組文庫(Genomic Library)定義:把某種生物基因組的全部遺傳信息通過克隆載體貯存在一個(gè)受體菌克隆子群體中,這個(gè)群體即為這種生物的基因組文庫。
cDNA文庫:以mRNA為模板,經(jīng)反轉(zhuǎn)錄酶催化,在體外反轉(zhuǎn)錄成cDNA,與適當(dāng)?shù)妮d體(常用噬菌體或質(zhì)粒載體)連接后轉(zhuǎn)化受體菌,則每個(gè)細(xì)菌含有一段cDNA,并能繁殖擴(kuò)增,這樣包含著細(xì)胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合稱為該組織細(xì)胞的cDNA文庫。cDNA文庫特異地反映某種組織或細(xì)胞中,在特定發(fā)育階段表達(dá)的蛋白質(zhì)的編碼基因,因此cDNA文庫具有組織或細(xì)胞特異性。
cDNA文庫是以特定的組織或細(xì)胞mRNA為模板,逆轉(zhuǎn)錄形成的互補(bǔ)DNA(cDNA)與適當(dāng)?shù)妮d體(常用噬菌體或質(zhì)粒載體)連接后轉(zhuǎn)化受體菌形成重組DNA克隆群,這樣包含著細(xì)胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合稱為該組織或細(xì)胞的cDNA文庫。cDNA文庫特異地反映某種組織或細(xì)胞中,在特定發(fā)育階段表達(dá)的蛋白質(zhì)的編碼基因,因此cDNA文庫具有組織或細(xì)胞特異性。
cDNA文庫顯然比基因組DNA文庫小得多,能夠比較容易從中篩選克隆得到細(xì)胞特異表達(dá)的基因。但對真核細(xì)胞來說,從基因組DNA文庫獲得的基因與從cDNA文庫獲得的不同,基因組DNA文庫所含的是帶有內(nèi)含子和外顯子的基因組基因,而從cDNA文庫中獲得的是已經(jīng)過剪接、去除了內(nèi)含子的cDNA。
真核生物基因組DNA十分龐大,其復(fù)雜程度是蛋白質(zhì)和mRNA的100倍左右,而且含有大量的重復(fù)序列. 采用電泳分離和雜交的方法,都難以直接分離到目的基因.這是從染色體DNA為出發(fā)材料直接克隆目的基因的一個(gè)主要困難。
高等生物一般具有10^5種左右不同的基因,但在一定時(shí)間階段的單個(gè)細(xì)胞或個(gè)體中,都僅有15%左右的基因得以表達(dá),產(chǎn)生約15000種不同的mRNA分子.可見,由mRNA出發(fā)的cDNA克隆,其復(fù)雜程度要比直接從基因組克隆簡單得多。
cDNA文庫在研究具體某類特定細(xì)胞中基因組的表達(dá)狀態(tài)及表達(dá)基因的功能鑒定方便具有特殊的優(yōu)勢,從而使它在個(gè)體發(fā)育、細(xì)胞分化、細(xì)胞周期調(diào)控、細(xì)胞衰老和死亡調(diào)控等生命現(xiàn)象的研究中具有更為廣泛的應(yīng)用價(jià)值,是研究工作中較常使用到的基因文庫。
產(chǎn)品名稱:illumina Nextera DNA文庫制備試劑盒 (24 samples) 產(chǎn)品貨號:FC-121-1030
現(xiàn)貨供應(yīng),歡迎咨詢
歡迎您的致電 400 、 021 、2200 150、 2101、 0459
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