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華雅旗下紅榮微再授權代理TAKARA Rubicon 文庫構建(illumina平臺)產品
Rubicon ThruPLEX® Plasma-seq Kit
ThruPLEX與所有Illumina平臺兼容
產品英文名稱:ThruPLEX® Plasma-seq Kit
產品中文名稱:血漿來源cell free DNA NGS文庫構建試劑
樣本:血漿來源的cfDNA(cell free DNA)和ctDNA(循環(huán)腫瘤DNA)
用途:WGS,WES,靶向測序,ctDNA分析
ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術,并用于血漿來源cfDNA高品質NGS文庫(illumina平臺)構建。
該試劑專門針對cell-free DNA進行優(yōu)化,在保持樣本GC代表性的基礎上,提升了文庫的信息容量。文庫構建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標區(qū)域進行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。
血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫,能有更好的靈敏度、更準確的基因變異分析結果。與其它液體活檢的樣品一樣,血漿由于其易獲得、價值高的特點,深受研究腫瘤學或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。
產品特點
專為cfDNA設計:修復及連接試劑配方更新,方法優(yōu)化
高品質NGS文庫:在寬廣的GC含量范圍內,可以達到高檢測再現性
起始量范圍廣:<1 ng到30 ng cfDNA量
快速簡便:單管、2小時、3步操作步驟,無需純化或樣品轉移步驟
應用領域:液體活檢、ctDNA、靶向測序等領域文庫構建
兼容自動化平臺:Beckman® FXP Workstation
ThruPLEX與所有Illumina平臺兼容
Designed for cell-free DNA: newly formulated repair and ligation reagents with optimized protocols
High performance NGS libraries: high diversity with broad and reproducible GC coverage
Variable sample input: <1 ng to 30 ng of cell-free DNA
Fast and simple workflow: 3 steps in a single tube or well in 2 hours with no purification or sample transfer steps
Research applications: libraries from samples where results require high sensitivity including liquid biopsies, ctDNA, and targeted sequencing
Automation-friendly: Beckman® FXP Workstation
產品應用
WGS,WES,靶向測序,ctDNA分析
cfDNA文庫構建,腫瘤及產前無創(chuàng)檢測(母體血漿中胎兒游離DNA分析)
ThruPLEX Plasma-seq 優(yōu)化用于cell-free DNA等液體活檢樣品
液體活檢樣品包括
循環(huán)核酸
– Cell-free DNA (cfDNA)
• 循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)占一小部分
及RNA 外泌體等
ThruPLEX技術原理
ThruPLEX技術和所有Illumina NGS平臺兼容。
技術要點:莖環(huán)形接頭
莖環(huán)形接頭的特別設計,免去了大多數Illumina等文庫制備技術需要的中間純化和樣品轉移步驟。整個實驗只需15分鐘手動操作且為1個反應管、2個小時、3步反應的簡單過程。僅在PCR反應后進行1次磁珠純化,純化造成的樣品損失低,可對珍貴樣品進行有效分析。
產品使用
適用樣本:液體活檢樣本
1ng-30ng 血漿、尿液來源的cfDNA
組份
分模板準備、文庫合成和文庫擴增三大部分。保存-20℃。
Template Preparation Buffer 模板準備緩沖液(紅色)
Template Preparation Enzyme 模板準備酶(紅色)
Library Synthesis Buffer文庫合成緩沖液(黃色)
Library Synthesis Enzyme文庫合成酶(黃色)
Library Amplification Buffer文庫擴增緩沖液(綠色)
Library Amplification Enzyme文庫擴增酶(綠色)
Nuclease-Free water 無核酸酶水(無色)
Indexing 試劑(藍色)
咨詢 1500 1904 520 紅榮微再-客服: 經銷商專員
自備材料:
PCR管或96孔PCR板和密封件
Low binding aerosol barrier tips
新鮮制備的80%(v / v)乙醇
Agencourt® AMPure® XP 磁珠(Beckman Coulter,目錄號A63880)
可選試劑:
KAPA®Library Quantification Kit – Illumina (Kapa Biosystems, CAT. NO. specific to real time PCR system used)
EvaGreen® Dye (20X in water, Biotium, CAT. NO. 31000-T)
Fluorescein Calibration Dye (Bio-Rad Laboratories
簡單的工作流程:一管反應
樣品加入PCR管。
準備模版修復混合液1(紅蓋),加入PCR管,反應。
準備文庫合成混合液2(黃蓋),加入PCR管,反應。
準備文庫擴增混合液3(綠蓋),加入PCR管,反應。
產品性能
高cell-free DNA文庫多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit構建的文庫,具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads。圖中表示cfDNA分別提取于3份血漿樣品,文庫定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測序,且每個文庫產生17 M到25 M reads。每個文庫在down-sampling數據至17 M reads以后,計算Duplication rates。
Rubicon R400490/R400491/R400492 訂購信息
貨號 | 名稱 | 規(guī)格 | 價格 |
R400490 | ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit | 12 Rxns | ¥9109 |
R400491 | ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit | 48 Rxns | ¥31533 |
R400492 | ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit | 96 Rxns | ¥56760 |
Rubicon公司成立于2000年,總部位于美國密歇根州。產品都擁有技術,檢控嚴格,擁有cGMP級生產能力,是單細胞測序文庫構建的。2017年1月,Rubicon 成為Takara的一員,并且發(fā)展良好。
華雅再生醫(yī)學旗艦公司:紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司主營細胞治療和精準醫(yī)療等產品,2018年與TAKARA繼續(xù)合作,授權代理(上海)其旗下Rubicon單細胞文庫構建試劑等產品。