近年來，靶向測序作為一種以有限測序量實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)基因深度研究的方案而被普遍采用。但是，開發(fā)定制 NGS panel 的過程并不像量體裁衣那么簡單，時(shí)至今日，仍然是一項(xiàng)需要投入大量時(shí)間精力甚至更多費(fèi)用的過程。
安捷倫作為 NGS 技術(shù)的，在捕獲探針設(shè)計(jì)方面已經(jīng)具備 10 多年的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)。安捷倫 SureDesign 在線設(shè)計(jì)平臺可為用戶提供便捷的定制化過程、驗(yàn)證服務(wù)以及專業(yè)的技術(shù)人員的一對一服務(wù)。
NGS Panel 之設(shè)計(jì)篇
SureDesign，是一款基于網(wǎng)頁的應(yīng)用程序，安捷倫客戶無需額外付費(fèi)即可使用。在 SureDesign 中，用戶可以選擇預(yù)定義內(nèi)容或構(gòu)建自己的內(nèi)容，瀏覽并購買安捷倫的目錄 Panel 和自定義設(shè)計(jì)，也可以與工作組內(nèi)部人員或其他研究人員進(jìn)行合作。安捷倫多年的制造專業(yè)知識，可確保用戶的每個(gè)探針性能相同，增強(qiáng)的探針設(shè)計(jì)算法，可進(jìn)行更靈敏，更具體的寡核苷酸設(shè)計(jì)。
NGS Panel 之合成篇
對于設(shè)計(jì)好的序列，安捷倫使用Agilent SurePrint 長鏈寡核苷酸合成平臺生產(chǎn)。在傳統(tǒng)的合成中，長鏈寡核苷酸的產(chǎn)量在 250 個(gè)核苷酸左右會出現(xiàn)嚴(yán)重下降。相比之下，使用 SurePrint 平臺生產(chǎn)的寡核苷酸即使長度接近 300 個(gè)核苷酸，也同樣具有高保真度，可幫助用戶獲得具有業(yè)內(nèi)高質(zhì)量的靶向捕獲探針文庫。SurePrint 技術(shù)專為寡核苷酸探針文庫的打印而開發(fā)，可實(shí)現(xiàn)先進(jìn)而一致的核酸合成。每個(gè)設(shè)計(jì)都能定制，這意味著用戶可以從頭到尾設(shè)計(jì)自己的 Panel。
NGS Panel 之驗(yàn)證篇
已經(jīng)合成好的探針需要反復(fù)的驗(yàn)證和調(diào)整才可用于大規(guī)模的樣本檢測。這個(gè)過程需要極富經(jīng)驗(yàn)的技術(shù)人員和大量的資金與時(shí)間投入，安捷倫 NGS 驗(yàn)證服務(wù)可以幫助客戶攻克這一難關(guān)。安捷倫的設(shè)計(jì)專家將會根據(jù)客戶的特殊需求幫助客戶一起設(shè)計(jì)出定制化的 Panel，之后專家們會使用 HapMap 參考樣本在實(shí)驗(yàn)室對設(shè)計(jì)出的 Panel 進(jìn)行驗(yàn)證和調(diào)整，直到滿足客戶的需求。用戶終收到的是經(jīng)過驗(yàn)證的 Panel，可以即刻開啟實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目。同時(shí)，安捷倫會做好保密工作，無需擔(dān)心設(shè)計(jì)外漏。把前期棘手的預(yù)實(shí)驗(yàn)部分交給安捷倫經(jīng)驗(yàn)豐富的驗(yàn)證團(tuán)隊(duì)，可在 6 周以內(nèi)就可以完成這一過程，幫助用戶更快速更便捷地進(jìn)行項(xiàng)目啟動。
安捷倫推出的設(shè)計(jì)驗(yàn)證服務(wù)大大縮短了用戶在“設(shè)計(jì) - 合成 - 運(yùn)輸 - 測試 - 修改設(shè)計(jì) - 重新下訂單 - 重新合成 - 運(yùn)輸 - 測試”的時(shí)間。安捷倫的專業(yè)團(tuán)隊(duì)不僅幫助用戶完成設(shè)計(jì)，同時(shí)對其用參考樣本進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)室驗(yàn)證，確保 Panel 的性能滿足用戶要求，并且在驗(yàn)證完成后提供了 16 個(gè)反應(yīng)的探針試劑供用戶直接使用。
